Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPTSSAQ969W0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms