Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC63Q8NA47 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms