Protein–RNA interactions for Protein: Q8N402

Putative uncharacterized protein LOC388882, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N402 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8N402 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8N402 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8N402 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8N402 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8N402 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8N402 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8N402 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8N402 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8N402 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8N402 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8N402 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8N402 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8N402 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8N402 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8N402 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8N402 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8N402 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8N402 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8N402 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8N402 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8N402 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8N402 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8N402 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8N402 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8N402 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8N402 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8N402 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8N402 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8N402 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8N402 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8N402 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8N402 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8N402 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8N402 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8N402 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8N402 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8N402 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8N402 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8N402 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8N402 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8N402 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8N402 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8N402 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8N402 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8N402 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8N402 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8N402 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8N402 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q8N402 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q8N402 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q8N402 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q8N402 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q8N402 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q8N402 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q8N402 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q8N402 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q8N402 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q8N402 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q8N402 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q8N402 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q8N402 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q8N402 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q8N402 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q8N402 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8N402 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8N402 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8N402 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8N402 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8N402 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8N402 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8N402 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8N402 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8N402 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8N402 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8N402 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8N402 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8N402 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8N402 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8N402 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8N402 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8N402 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8N402 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8N402 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8N402 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8N402 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8N402 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8N402 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8N402 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8N402 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8N402 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8N402 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8N402 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8N402 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8N402 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8N402 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8N402 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8N402 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8N402 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8N402 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms