Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX29P2Q8IUI4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms