Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT28Q7Z3Y7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms