Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms