Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms