Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L1Q676U5 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms