Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGAP6Q5VW22 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
AGAP6Q5VW22 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms