Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms