Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
COLEC12Q5KU26 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COLEC12Q5KU26 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms