Protein–RNA interactions for Protein: Q56NI9

ESCO2, N-acetyltransferase ESCO2, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESCO2Q56NI9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ESCO2Q56NI9 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ESCO2Q56NI9 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ESCO2Q56NI9 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ESCO2Q56NI9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ESCO2Q56NI9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ESCO2Q56NI9 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ESCO2Q56NI9 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ESCO2Q56NI9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ESCO2Q56NI9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ESCO2Q56NI9 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ESCO2Q56NI9 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ESCO2Q56NI9 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ESCO2Q56NI9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ESCO2Q56NI9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ESCO2Q56NI9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ESCO2Q56NI9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ESCO2Q56NI9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ESCO2Q56NI9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ESCO2Q56NI9 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ESCO2Q56NI9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ESCO2Q56NI9 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ESCO2Q56NI9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ESCO2Q56NI9 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ESCO2Q56NI9 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ESCO2Q56NI9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ESCO2Q56NI9 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ESCO2Q56NI9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ESCO2Q56NI9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ESCO2Q56NI9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ESCO2Q56NI9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ESCO2Q56NI9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ESCO2Q56NI9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ESCO2Q56NI9 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ESCO2Q56NI9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ESCO2Q56NI9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ESCO2Q56NI9 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ESCO2Q56NI9 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ESCO2Q56NI9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ESCO2Q56NI9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ESCO2Q56NI9 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ESCO2Q56NI9 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms