Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKDCCQ504Y2 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms