Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC39A12Q504Y0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms