Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM259Q4ZIN3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms