Protein–RNA interactions for Protein: Q499Z3

SLFNL1, Schlafen-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFNL1Q499Z3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLFNL1Q499Z3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms