Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms