Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A3Q16572 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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