Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYPL1Q16563 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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