Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP2Q16527 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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