Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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RPE65Q16518 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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RPE65Q16518 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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RPE65Q16518 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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