Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PMCHL1Q16048 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms