Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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SCN9AQ15858 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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SCN9AQ15858 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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SCN9AQ15858 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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SCN9AQ15858 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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SCN9AQ15858 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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SCN9AQ15858 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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SCN9AQ15858 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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SCN9AQ15858 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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SCN9AQ15858 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCN9AQ15858 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCN9AQ15858 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
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