Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NPTX1Q15818 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPTX1Q15818 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms