Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms