Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 PRR13-206ENST00000549135 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.971e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 PRR13-207ENST00000549581 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -11e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 PRR13-205ENST00000549068 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.021e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 PRR13-203ENST00000546581 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.031e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 NUP214-208ENST00000483497 3275 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.041e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 PRR13-204ENST00000547368 688 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.091e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 HMBS-213ENST00000542345 882 ntTSL 37.87□□□□□ -1.151e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 EPS8L2-225ENST00000533816 540 ntTSL 522.24■■□□□ 1.152e-11■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.082e-11■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 NOTUM-204ENST00000489218 972 ntTSL 221.15■□□□□ 0.982e-11■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 EPS8L2-202ENST00000524474 907 ntTSL 220.99■□□□□ 0.952e-11■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 EPS8L2-217ENST00000530452 704 ntTSL 320.5■□□□□ 0.872e-11■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 EPS8L2-220ENST00000531393 2304 ntTSL 1 (best)20.2■□□□□ 0.822e-11■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 EPS8L2-212ENST00000528770 2233 ntTSL 218.04■□□□□ 0.482e-11■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 EPS8L2-207ENST00000526651 572 ntTSL 417.93■□□□□ 0.462e-11■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 SLC6A8-202ENST00000413787 468 ntTSL 519.95■□□□□ 0.782e-7■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 RN7SKP203-201ENST00000363618 332 ntBASIC14.67□□□□□ -0.062e-7■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 LMNB1-204ENST00000463908 557 ntTSL 420.89■□□□□ 0.931e-18■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.921e-18■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 LMNB1-206ENST00000492190 738 ntTSL 319.58■□□□□ 0.721e-18■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 LMNB1-203ENST00000460265 3475 ntTSL 1 (best)15.66■□□□□ 0.11e-18■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.071e-18■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 LMNB1-208ENST00000504788 1801 ntTSL 25.44□□□□□ -1.541e-18■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 LMNB1-205ENST00000472034 730 ntTSL 34.54□□□□□ -1.681e-18■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 MAN2A2-214ENST00000559558 562 ntTSL 419.59■□□□□ 0.734e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 MAN2A2-207ENST00000558374 731 ntTSL 37.81□□□□□ -1.164e-6■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 NOP58-207ENST00000478941 508 ntTSL 36.64□□□□□ -1.358e-19■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC4.28□□□□□ -1.728e-19■□□□□ 8.3
PCBP1Q15365 CPNE1-207ENST00000414664 1070 ntTSL 528.07■■■□□ 2.082e-19■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 RBM12-204ENST00000424458 1068 ntTSL 228.07■■■□□ 2.082e-19■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 CPNE1-212ENST00000430570 1332 ntTSL 527.7■■■□□ 2.032e-19■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 CPNE1-217ENST00000439669 784 ntTSL 526.63■■□□□ 1.852e-19■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 CPNE1-220ENST00000458038 596 ntTSL 324.08■■□□□ 1.452e-19■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 CPNE1-211ENST00000420363 821 ntTSL 223.77■■□□□ 1.42e-19■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 CPNE1-219ENST00000440240 746 ntTSL 523.15■■□□□ 1.32e-19■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 CPNE1-210ENST00000416778 744 ntTSL 219.89■□□□□ 0.772e-19■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 CPNE1-213ENST00000434795 831 ntTSL 319.89■□□□□ 0.772e-19■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.482e-19■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 CPNE1-208ENST00000414711 673 ntTSL 517.54■□□□□ 0.42e-19■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 CPNE1-215ENST00000437100 826 ntTSL 516.32■□□□□ 0.22e-19■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.142e-19■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 CPNE1-206ENST00000412056 998 ntTSL 315.38■□□□□ 0.052e-19■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 RBM12-202ENST00000374104 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.52e-19■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 CPNE1-214ENST00000435747 400 ntTSL 311.42□□□□□ -0.582e-19■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 AL109827.1-202ENST00000441563 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 211.03□□□□□ -0.642e-19■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 AL109827.1-201ENST00000454607 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 211.03□□□□□ -0.642e-19■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 CPNE1-218ENST00000439806 748 ntTSL 510.94□□□□□ -0.662e-19■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 RBM12-203ENST00000374114 6662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.972e-19■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 MLXIPL-208ENST00000456640 706 ntTSL 519.08■□□□□ 0.645e-11■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 DVL1-207ENST00000633096 580 ntTSL 426.34■■□□□ 1.811e-8■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 DVL1-208ENST00000634054 828 ntTSL 523.9■■□□□ 1.421e-8■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.281e-8■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.191e-8■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.071e-8■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.011e-8■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.981e-8■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.951e-8■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 LSM14A-207ENST00000589878 559 ntTSL 420.36■□□□□ 0.851e-8■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.481e-8■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.371e-8■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.261e-8■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 LSM14A-205ENST00000586157 944 ntTSL 515.9■□□□□ 0.141e-8■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 DMPK-206ENST00000588522 2920 ntTSL 515.88■□□□□ 0.131e-8■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 HSPA9-212ENST00000523929 780 ntTSL 415.75■□□□□ 0.111e-8■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 HSPA9-207ENST00000507097 1796 ntTSL 214.4□□□□□ -0.11e-8■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.121e-8■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.131e-8■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.211e-8■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 UBR4-203ENST00000375225 1533 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.364e-20■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 DVL1-205ENST00000631679 778 ntTSL 512.8□□□□□ -0.361e-8■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 HSPA9-210ENST00000508003 582 ntTSL 212.51□□□□□ -0.411e-8■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 RPS5-208ENST00000599909 523 ntTSL 212.46□□□□□ -0.412e-12■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 UBR4-208ENST00000459947 3873 ntTSL 211.96□□□□□ -0.54e-20■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 AL137127.1-201ENST00000606379 3402 ntBASIC10.9□□□□□ -0.664e-20■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 HSPA9-201ENST00000297185 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.671e-8■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 UBR4-202ENST00000375224 3475 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.024e-20■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 UBR4-214ENST00000486515 536 ntTSL 37.64□□□□□ -1.194e-20■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.384e-20■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 HSPA9-202ENST00000501917 275 ntTSL 33.68□□□□□ -1.821e-8■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.174e-9■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.044e-9■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.134e-9■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 GSN-211ENST00000477553 680 ntTSL 213.96□□□□□ -0.174e-13■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 PEG10-203ENST00000488574 2587 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.424e-9■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 KDELR2-205ENST00000463747 376 ntTSL 511.75□□□□□ -0.534e-9■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 KDELR2-202ENST00000382267 583 ntTSL 410.97□□□□□ -0.654e-9■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.984e-9■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 KDELR2-204ENST00000462052 382 ntTSL 28.88□□□□□ -0.994e-9■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 FASN-209ENST00000636628 100 ntTSL 55.16□□□□□ -1.584e-9■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 HNRNPA2B1-203ENST00000360787 1724 ntTSL 515.7■□□□□ 0.11e-12■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 HNRNPA2B1-206ENST00000490912 5328 ntTSL 215.28■□□□□ 0.041e-12■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 HNRNPA2B1-204ENST00000463181 6284 ntTSL 213.91□□□□□ -0.181e-12■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 HNRNPA2B1-202ENST00000356674 1711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.331e-12■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 HNRNPA2B1-208ENST00000618183 3539 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.641e-12■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 HNRNPA2B1-201ENST00000354667 3664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.131e-12■□□□□ 8.2
PCBP1Q15365 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC4.01□□□□□ -1.779e-15■□□□□ 8.1
PCBP1Q15365 DSP-202ENST00000418664 7812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.675e-12■□□□□ 8.1
PCBP1Q15365 DSP-201ENST00000379802 9796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.765e-12■□□□□ 8.1
PCBP1Q15365 MTHFR-202ENST00000376583 7044 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.442e-9■□□□□ 8.1
PCBP1Q15365 MTHFR-205ENST00000376592 8378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.452e-9■□□□□ 8.1
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