Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKX1-1Q15270 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms