Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPAQ15257 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms