Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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NECTIN1Q15223 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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NECTIN1Q15223 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NECTIN1Q15223 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
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