Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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PRKD1Q15139 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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PRKD1Q15139 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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PRKD1Q15139 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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PRKD1Q15139 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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PRKD1Q15139 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRKD1Q15139 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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