Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EEA1Q15075 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms