Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CLCA4Q14CN2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms