Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC10A1Q14973 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms