Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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GBX1Q14549 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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GBX1Q14549 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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GBX1Q14549 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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GBX1Q14549 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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GBX1Q14549 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBX1Q14549 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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GBX1Q14549 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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GBX1Q14549 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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