Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPIDRQ14159 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SPIDRQ14159 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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