Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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PDE6HQ13956 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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PDE6HQ13956 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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PDE6HQ13956 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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PDE6HQ13956 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PDE6HQ13956 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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PDE6HQ13956 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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PDE6HQ13956 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PDE6HQ13956 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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