Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms