Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP1A4Q13733 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP1A4Q13733 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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