Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDH18Q13634 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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CDH18Q13634 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDH18Q13634 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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