Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNW1Q13573 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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