Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LSAMPQ13449 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
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