Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 IDH2-204ENST00000560061 1449 ntTSL 220.66■□□□□ 0.91e-11■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.281e-11■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 TPM3-219ENST00000509409 1248 ntTSL 218.78■□□□□ 0.62e-26■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.252e-26■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.232e-26■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.172e-26■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 TPM3-223ENST00000611659 3149 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.342e-26■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 TPM3-207ENST00000341372 2007 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.462e-26■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 TPM3-212ENST00000368533 3131 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.522e-26■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 TPM3-201ENST00000271850 1219 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.662e-26■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 TPM3-213ENST00000368545 2147 ntTSL 1 (best)9.78□□□□□ -0.842e-26■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 TPM3-215ENST00000469717 4041 ntTSL 28.51□□□□□ -1.052e-26■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 FKBP4-207ENST00000544366 287 ntTSL 34.73□□□□□ -1.651e-8■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.22e-6■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.172e-6■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 ELOVL5-201ENST00000304434 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.942e-7■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 ELOVL5-207ENST00000542638 2875 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.952e-7■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.282e-7■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 SF3A3-201ENST00000373019 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.742e-7■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.282e-15■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.234e-8■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.184e-8■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.984e-8■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.844e-8■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 NDRG2-244ENST00000555650 1588 ntTSL 219.14■□□□□ 0.654e-8■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.634e-8■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 NDRG2-271ENST00000557353 1919 ntTSL 218.21■□□□□ 0.514e-8■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.484e-8■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.434e-8■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.394e-8■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.374e-8■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.374e-8■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.294e-8■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.054e-8■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.024e-8■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 NDRG2-258ENST00000556716 2718 ntTSL 214.86□□□□□ -0.034e-8■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 NDRG2-274ENST00000557633 527 ntTSL 313.91□□□□□ -0.184e-8■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 ANAPC15-202ENST00000438939 330 ntTSL 38.49□□□□□ -1.057e-8■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 ANAPC15-206ENST00000537644 606 ntTSL 37.54□□□□□ -1.27e-8■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 CD59-205ENST00000437761 758 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.111e-6■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 CD59-208ENST00000527577 686 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.481e-6■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 CD59-204ENST00000426650 741 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.51e-6■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 CD59-206ENST00000445143 825 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.881e-6■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 RPS8-205ENST00000474582 391 ntTSL 1 (best)14.07□□□□□ -0.161e-49■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.592e-7■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.365e-7■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 DDRGK1-203ENST00000470203 480 ntTSL 314.2□□□□□ -0.145e-7■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 DDRGK1-204ENST00000496781 865 ntTSL 1 (best)13.45□□□□□ -0.265e-7■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.61e-6■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 UBR4-202ENST00000375224 3475 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.968e-9■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.338e-9■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 RPL24-204ENST00000470961 572 ntTSL 213.29□□□□□ -0.282e-17■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.021e-9■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.551e-9■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.21e-9■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.971e-9■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 PSMA4-212ENST00000559365 786 ntTSL 532.77■■■□□ 2.841e-10■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 PSMA4-215ENST00000559934 2741 ntTSL 1 (best)23.68■■□□□ 1.381e-10■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 PSMA4-203ENST00000557929 635 ntTSL 511.07□□□□□ -0.641e-10■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 PSMA4-216ENST00000559948 710 ntTSL 510.77□□□□□ -0.691e-10■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 PSMA4-210ENST00000559146 674 ntTSL 29.78□□□□□ -0.841e-10■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 PSMA4-213ENST00000559437 756 ntTSL 59.68□□□□□ -0.861e-10■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 PSMA4-211ENST00000559154 637 ntTSL 27.96□□□□□ -1.141e-10■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 PSMA4-220ENST00000560737 815 ntTSL 56.41□□□□□ -1.381e-10■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.641e-6■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 USP7-208ENST00000563961 4533 ntTSL 515.75■□□□□ 0.111e-6■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.496e-37■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 TUBA1C-209ENST00000552448 1800 ntTSL 311.9□□□□□ -0.56e-37■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 TUBA1C-210ENST00000639419 1075 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.636e-37■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 TUBA1C-202ENST00000541364 1695 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.646e-37■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.683e-8■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 CREB3L1-205ENST00000616094 1817 ntTSL 1 (best)14.7□□□□□ -0.063e-8■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.051e-8■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 STUB1-206ENST00000565813 337 ntTSL 314.47□□□□□ -0.093e-8■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 TIMM50-211ENST00000598125 577 ntTSL 322.65■■□□□ 1.227e-7■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 TIMM50-204ENST00000595286 698 ntTSL 221.75■■□□□ 1.077e-7■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 TIMM50-203ENST00000594583 680 ntTSL 320.98■□□□□ 0.957e-7■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 TIMM50-210ENST00000597782 456 ntTSL 520.43■□□□□ 0.867e-7■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 TIMM50-212ENST00000599733 669 ntTSL 316.57■□□□□ 0.247e-7■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 RPL17-210ENST00000581091 573 ntTSL 213.8□□□□□ -0.21e-7■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 1012 ntTSL 58.29□□□□□ -1.081e-7■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.091e-7■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.048e-8■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.88e-8■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.788e-8■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.625e-7■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 NDUFS8-210ENST00000528492 353 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.225e-7■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.964e-6■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.944e-6■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.187e-12■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.128e-8■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 KANSL1-215ENST00000576870 2848 ntTSL 213.35□□□□□ -0.274e-6■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 KANSL1-211ENST00000575318 4935 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.334e-6■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 KANSL1-208ENST00000574590 5147 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.344e-6■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 KANSL1-201ENST00000262419 5309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.354e-6■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 KANSL1-205ENST00000572904 4973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.764e-6■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 KANSL1-204ENST00000572218 9095 ntTSL 1 (best)9.88□□□□□ -0.834e-6■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.594e-7■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.334e-7■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 TBL1X-206ENST00000424279 5451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.374e-7■■■□□ 15.7
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