Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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