Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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PRKAA1Q13131 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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PRKAA1Q13131 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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PRKAA1Q13131 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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PRKAA1Q13131 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
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PRKAA1Q13131 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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PRKAA1Q13131 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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PRKAA1Q13131 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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PRKAA1Q13131 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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PRKAA1Q13131 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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