Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF3Q13114 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms