Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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