Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NPRL3Q12980 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms