Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LMAN2Q12907 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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