Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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