Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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GTF3C1Q12789 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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GTF3C1Q12789 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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GTF3C1Q12789 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
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GTF3C1Q12789 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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GTF3C1Q12789 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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GTF3C1Q12789 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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GTF3C1Q12789 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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GTF3C1Q12789 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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